哈佛大学生物医学信息学专业详解

哈佛大学生物医学信息学硕士专业由哈佛医学院生物医学信息学系提供,它提供给有志于从事对数据科学技能有很高要求的生物医学行业的学生。学生有机会向整个哈佛大学的专家们学习。毕业生对生物医学信息学领域的基础知识和原理有充分的理解,有能力将众多方法和技能运用于选定的行业。

1. 学位要求

哈佛医学院的生物医学信息学专业提供两条入学的路径。对于持有学士学位(48个学分)的学生,它要求具备优秀的定量分析能力。

对于持有博士学位或者注册医学博士(MD)项目(36个学分)的学生,它要求:

a. 持有生物医学学位,并认可信息学与数据科学在个人研究中的相关性。

b. 有意向拿到临床信息学进修资格。

c. 有意向在医学实践中挖掘信息学的重要意义。

针对以上两类学生的课程都提供知识框架,便于将系统的定量方法熟练地运用到自己的领域。项目包含实践拓展训练营、一系列设计定量合生物医学学科的基础课程,以及精准施药、数据科学、数据可视化等新兴领域的课程。

所有学生都需要完成一个顶石研究项目,参与纵向的系列研讨会。

2. 入学要求

生物医学信息学硕士新生必须具备相关专业的本科知识,比如生物信息学、数学、计算机科学、统计学、物理学、机械工程、化学工程。必须具备一定的生物统计学基础,比如假设检验、线性回归、分类。必须了解分类器(classifier),分类器的检测及诊断。

此外,必须具备一定的程序设计和计算机科学知识,至少有一门程序语言经历(包括算法、变量、控制结构相关知识),对R编程语言有基本的认识,了解文件管理、数据解析、基础数据库原理等数据处理知识。

3. 课程

第一年:秋

第一年秋季学期学习生物医学信息学基础I(4个学分)、生物医学信息学计算能力(2个学分)、生物医学科学计算机统计学(2个学分)、生物医学信息学主题(4个学分)、定量基因组学(4个学分)。

第一年:春

学习生物生物医学信息学基础II(4个学分)、计算生物学与生物信息学导论(4个学分)、数据科学I:环境暴露原-基因组-表型组连接分析方法(2个学分)、数据科学II:生物医学应用的数据可视化(2个学分)、深度学习(2个学分)。

第二年:秋

第二年秋季学期学习精准施药I:基因组医学(2个学分)、精准施药II:综合临床与基因组数据(2个学分)、顶石项目(6个学分)。

请注意,这个课程体系表示的是生物医学信息学硕士专业常见的课程,实际上每年的课程可能有不同。

4. 顶石项目

顶石项目(capstone project)是生物医学信息学硕士课程的补充,它根据每位学生的专业知识和兴趣来设定,由导师指导,提供实践体验。参与项目的学生可匹配到一名善于将定量分析方法和工程应用于生物医学的教员。

学生将同导师合作,参与生物医学信息学研究。在同兴趣领域的生物医学信息学精英协作的过程中,将课堂所学应用,从而获得实用而真切的理解。

顶石项目通常涉及新方法新工具的开发、数据资源的创建以及生物医学数据的分析。